朝天椒放冷庫能保存2至3個月左右，為了保證朝天椒的品質，降低朝天椒的呼吸強度，延緩朝天椒衰老和品質下降，冷庫溫度設置在8度至12度為宜，同時，冷庫的相對濕度要控制在90%至95%。

在儲存朝天椒過程中，一定要保證庫內溫度、濕度穩定，溫度過高過低都不行。溫度過高會加速辣椒腐爛從而滋生病菌。如果貯藏溫度過低，朝天椒中含有少量水分其中的水分會凍成冰，從而會破壞掉朝天椒的品質。如果庫內濕度不足時，可用普通空氣加濕器或微波空氣加濕器進行加濕，以保持庫內濕度穩定。

想要冷庫達到預期內的保鮮效果，朝天椒在冷庫儲存期間的管理也十分重要。冷庫須每隔2周檢查朝天椒的硬度、可溶性固形物、色、香、味等指標，確保其品質為極好的狀態。并且要定期進行通風換氣，防止庫內空氣污濁，保持冷庫空氣清新潔凈。